B2B供应链网站系统是一个较为复杂的系统，其整体架构可以分为以下几部分。

1. 前端展示层：用户通过此层进行网站的浏览、搜索、购买等操作。前端展示层包括网站的页面设计、布局、显示内容等。

2. 应用服务层：负责业务逻辑的实现，包括用户注册、登录、订单管理、支付、物流跟踪等。应用服务层通常使用自己独立的服务接口，以提供各种服务。

3. 数据访问层：负责访问数据库，提供数据的增删改查等操作。数据访问层封装了数据的访问，可以屏蔽底层数据库的差异。

4. 基础设施层：提供一些公共功能，例如安全管理、日志记录、缓存、消息队列、图片存储等。

5. 数据库：存储各种业务数据，包括用户信息、订单信息、商品信息等。可以使用关系型数据库或者MySQL数据库。

另外，B2B供应链网站的整体架构通常会包括如下几个模块：

1. 后台管理系统：提供给管理员对网站的管理操作，例如商品管理、订单管理、财务管理等。

2. 商品管理模块：包括对商品的添加、编辑、上架下架等操作。

3. 订单管理模块：包括对订单的查询、修改、发货、退款等操作。

4. 财务管理模块：包括对财务数据的统计、查询、结算等操作。

5. 在线客服系统：包括在线聊天、咨询、答疑等功能，提供给用户以及供应商的帮助和支持。

综上所述，B2B供应链网站系统整体架构比较复杂，需要各个模块之间的协作和配合，才能实现系统的高效运营。